Справка о доходах

Законно.
во-первых, сам закон "о коммерческой тайне" содержит перечень исключений - сведений, которые тайной не являются. среди них "информация, обязательность раскрытия которой или недопустимость ограничения доступа к которой установлена иными федеральными законами". иными словами: тайной не может быть то, что другие федеральные законы требуют предоставить (открыть, рассказать, дать). к слову, сведения об оплате труда тайной не могут быть все по тому же закону и сами по себе.
во-вторых, требование о предоставлении сведений о доходах члена семьи (в данном случае жены) - совершенно законно, поскольку установлено федеральным законом - "о противодействии коррупции" (статья 8).

отсюда: режим коммерческой тайны в отношении заработной платы супруга (супруги) лица, занимающего должность государственной службы, не действует. просто потому, что эту информацию прямо обязывает раскрыть федеральный закон (в данном случае "о противодействии коррупции").
настаивать на ином - гарантировано поиметь неприятности мужу. ага, вплоть до увольнения с красивой записью "за утрату доверия" (упомянутый выше закон это не просто предусматривает, а прямо предписывает).

на работе выдать справку 2-ндфл по вашему запросу просто обязаны. даже без озвучивания причин, зачем вам это надо. никакое пложение о коммерческой тайне не может противоречить трудовому кодексу, а по нему все документы, связанные с работой (в том числе и о заработке) выдаются по первому же запросу работника безо всяких ограничений.