Какой гарантийный срок является верным: который в договоре или в акте сдачи-приёмки работ?

Договор и акт это два равноценных документа. ни один из них не имеет приоритета перед другим. поэтому, с правовой точки зрения, условие о гарантийном сроке у вас не согласовано (то есть, договор в этой части не заключен и не подлежит применению).
поэтому, вы, как исполнитель, можете добросовестно исполнять гарантийные обязательства в течение 6 мес, а после - прекратить. и если заказчика это не устроит, то пусть идет в суд.
а дальше, уже суд будет решать был ли установлен ли гарантийный срок, и если был, то какой продолжительностью.