Правомерно ли взымать исполнительский сбор по исполнительному листу, если должник отбывает срок в колонии?

Нет не правомерен. Исполнительский сбор это штрафная санкция за невыполнение требований. Если должник отбывает срок наказания в МЛС то не имеет возможности исполнить требования исполнительного документа добровольно в установленный срок а срок 5 дней, следовательно это уважительная причина и она освобождает от уплаты сбора: ФЗ "Об исполнительном производстве" п.2 ст. 112