Для возмещения 13% НДФЛ с квартиры нужно в налоговую предоставить справку 2 НДФЛ за год. А если только за полгода?

Конечно, можно. Хоть за месяц. Справка 2-НДФЛ подтверждает Ваш доход и сумму удержанного с него налога на доходы физических лиц, который собственно и возвращается. Так что Ваше право на получение вычета от того, что доход у вас был в течение не всего года, а его части, никак не пострадает - Вы просто получите меньшую сумму (в пределах уплаченного в году налога) и период получения вычета слегка растянется. Только и всего.