Есть вопрос. подскажите, в каких органах писать заявление, то что я не разрешила ехать ребёнку с отцом на украину.

А ваше разрешение и не требуется. для пограничников достаточно присутствие одного из родителей, второй не нужен. вы конечно можете оспорить и написать заявление в фмс по месту жительства о вашем категорическом запрете. да только во первых решение будет принимать сам фмс, а не вы, а он обычно таких запретителей "а баба яга - против!" не жалует. а во вторых, пока он выдаст решение да передаст его на посты погранконтроля - ваш муж успеет с ребенком уже вернуться.