Что нам делать в такой ситуации?

Вот именно, какие?
никакие права вашего ребенка не нарушаются. просто так организован в школе образовательный процесс. отлично придумано, кстати - при такой системе ребенок не отстанет сильно ни по какому предмету, а родители всегда в курсе его успеваемости.
скажите еще, что учителя нарушают права ребенка тем, что двойки ему ставят.
что делать - контролировать учебный процесс и следить за тем, чтобы ребенок вовремя выполнял задания, чтобы никакие "долги" не образовывались и не было поводов для слез.