Пришла квартплата в которой указано что проживают двое, хотя никто не прописан.

Нет, это незаконно. согласно постановлению № 354 ( пункт 56 (1)) в случае, если ук считает, что в квартире фактически проживают незарегистрированные лица-они обязаны составить акт об этом, причем в присутствии собственника, а если собственник отсутствует в момент составления акта-то направить ему его копию. затем этот акт передается участковому. затем привлекаются к адм. ответственности лица, проживающие без регистрации и собственник и выносится соответствующее постановление.
и только в этом случае можно взимать плату за фактически проживающих. на основании акта и постановления.