Возможно ли повторное обращение в архитектуру, если был отказ?

Добрый день, в 2007 году были куплены 2 квартиры на первом этаже многоквартирного дома. заказали проект на переоборудование с входным узлом, получили постановление (разрешение на перепланировку). в процессе переоборудования немного ушли от проекта (не нарушая несущих стен). прошло 10 лет. решили узаконить. заказали тех паспорт по проекту. пришла комиссия и выявила несоответствие. отказ в акте ввода в эксплуатацию.
как поступить в данной ситуации?:
- сделать все по проекту и обратиться в архитектуру о вызове комиссии
- обратиться в суд сразу
во втором случае я боюсь отказа
возможен ли вызов комиссии по этому же вопросу повторно?