Tакой вопрос: два собственника жилья – один желает продать квартиру, другой против, при этом у одного прописаны дети.

Можно ли выписать детей из квартиры, того кто против? нельзя! несовершеннолетние дети должны проживать по месту жительства родителей (ля) и только они вправе менять свое место жительство, но вместе с детьми.
регистрация и продажа недвижимости между собой никак не связаны.
если второй собственник против продажи своей доли, а он имеет право, ибо только собственник вправе распорядится своим имуществом (ст 209 гк рф) https://www.zakonrf.info/gk/209/ никакой суд заставить его не вправе. только договариваться или делать предложение по правилам ст. 250 гк рф http://www.consultant.ru/document/cons_doc_law_5142/b1e54121d0fbe0a69b5e406b28bc8c0f9befc717/и продавать свою долю, если не хочет выкупить, третьему лицу.