Суд хочет выписать из квартиры т. к я там не проживаю.

Суд не имеет права "выписать", нет таких полномочий.
может рассмотреть чей-то иск о признании вас прекратившим право пользования и например при наличии оснований, и в случае удовл. иска истец на основании реш. суда вас снимет с регистр. учета по месту жительства.
кто именно собирается вас признать прекративш. право пользования и снять с регистр. учета по месту жительства и на каком основании?
у кого из физлиц жилое помещение в собственности (вы явл. ли собственником жилого помещения или доли праве) или муниципальное и там по дог. соцнайма проживают некие граждане (наниматель и члены семьи нанимателя. и вы кто-то из них)?
-------------
а в москве как раз вы снимаете квартиру по дог. найма или поднайма (или дог. безвозмездного пользования?), и на основании договора обязаны зарегиться по месту пребывания.
у гражданина одновременно может быть постоянная регистрация - по месту жительства (на родине у вас например), и временная- по месту пребывания.
вы просто временно отсутствуете- работаете в др. насел. пункте и там временно проживаете соответственно.