Имеют ли право отказать в открытии лицевого счета, если в жилье никто не прописан?

Нет не имеет. т. к. жк рф статья 155. внесение платы за жилое помещение и коммунальные услуги
п 7. собственники помещений в многоквартирном доме, в котором не созданы товарищество собственников жилья либо жилищный кооператив или иной специализированный потребительский кооператив и управление которым осуществляется управляющей организацией, плату за жилое помещение и коммунальные услуги вносят этой управляющей организации, за исключением случаев, предусмотренных статьей 171 настоящего кодекса.
7.5. в случаях, предусмотренных статьей 157.2 настоящего кодекса, плата за коммунальные услуги вносится собственниками помещений в многоквартирном доме и нанимателями жилых помещений по договорам социального найма или договорам найма жилых помещений государственного либо муниципального жилищного фонда в данном доме соответствующей ресурсоснабжающей организации и региональному оператору по обращению с твердыми коммунальными отходами.
11. неиспользование собственниками, нанимателями и иными лицами помещений не является основанием невнесения платы за жилое помещение и коммунальные услуги. при временном отсутствии граждан внесение платы за отдельные виды коммунальных услуг, рассчитываемой исходя из нормативов потребления, осуществляется с учетом перерасчета платежей за период временного отсутствия граждан в порядке и в случаях, которые утверждаются правительством российской федерации.
поэтому, они не в праве требовать регистрации собственника, т. к. собственник и так обязан оплачивать свою собственность даже если он там не зарегистрирован. регистрация носит уведомительный характер, что собстно и сделал собственник показав свой паспорт, обязанности регистрироваться в собственности у него нет. см. конституцию о свободе перемещения.
на этом основании отказ в заключении договора не правомерен.