Секретарем аппарата или секретарь зс

Будучи секретарем с/з Вы видите "живой" процесс, поведение сторон и председательствующего, а не только бумаги. Насчёт "неудобно и некрасиво" - решать Вам. Отчасти реакция работников суда, из которого хотите уйти. зависит от их личных качеств. Моя подруга в своём время ушла "по собственному" из областного суда в другую госструктуру, так ей кости мыли не один год при случае упоминания её фамилии. Тем не менее - добилась бОльшего, чем те, кто начинал вместе с ней в суде и там остался ...