Имеет ли право сотрудник на компенсацию согласно постановлению правительства рф 1223 исли улучшил жил.усл. взяв ипотеку

Вот именно - имеет право на имущественный налоговый вычет. А упомянутую Вами "компенсацию" (точнее говоря - единовременную социальную выплату) он не получит. В том же документе сказано: 19. Сотрудник снимается с учета для получения единовременной выплаты: б) в случае изменения (улучшения) жилищных условий, в результате которого утрачиваются основания получения единовременной выплаты;