Может ли мэрия через суд отобрать приватизированную в 2009г. комнату в коммуналке полученную от государства в 2002 г.?

Вы, либо ошиблись в постановке вопроса, либо чего-то не договорили. Но, при любом раскладе, законно приватизированная часть, чего бы то ни было, законна, - и суд - на вашей стороне! Любые проблемы (с банками, коммунальщиками ...) - особое рассмотрение и к теме не относятся. Но, если вышесказанные проблемы все же были и вы в своей жизни подписали кучу бумаг - не исключено, что по решению суда ваш законный кусок - вам принадлежать перестанет!. Удачи.