Должен ли я платить за отключение стояков при ремонте вентилей в своей квартире?

Вы совершенно правы - вентиль стояка водоснабжения, т. е. "первый запорно-регулировочный кран на отводе внутриквартирной разводки от стояка" это, действительно, часть общего имущества мкд!
именно так установлено п. 5 "правил содержания общего имущества в мкд..." (утв. постановлением правительства рф от 13.08.2006 n 491 в ред. от 09.07.2016)
а значит, все текущие ремонты, связанные со стояками, включая оплату замены отказавшего вентиля и его установку, вы давно уже оплатили, путем внесения ежемесячной квартплаты, в состав которой включена и плата за содержание и текущий ремонт общего имущества в мкд.