Можно ли внести изменения в согласие на обработку персональных данных?

Какие вы изменения внести хотите? не желаете пользоваться услугами банка, предлагаемого учебным заведением? ну, откажитесь, имеете на это право. заведите карту мир в любом другом удобном для вас банке. а то, может она вам и вовсе не пригодится никогда, если стипендию получать не будете .
а согласие на передачу персональных данных - это просто формальность. хочется вам или нет, учебное заведение обязано вести воинский учет и предоставлять в военкомат необходимую информацию. это федеральный закон.
а вообще, договор типовой и никто под вас и ваше личное мнение его переписывать и исправлять не будет. не устраивает такой договор, не подписывайте и откажитесь от получения образовательных услуг.
только в дальнейшем вам также придется отказаться и от официального трудоустройства, и от получения медицинских услуг, от кредитов и ипотек, и т. п., т. к. согласие на обработку и передачу персональных данных требуется везде.