Может ли собственник жилья выписать временно зарегистрированного к нему человека без его согласия

Однозначно ответить невозможно. Можно попробовать в суде признать утратившим право пользования, но если вы вселяли человека в качестве члена семьи на 3 месяца и хотите его выселить и снять с учета раньше, то в суде вряд ли это получится, увы...Законом не предусмотрено случаев досрочного снятия с рег. учета гражданина. Если бы вы не указали дату - было бы гораздо проще.