При передаче ООО на мое имя какие действия я должен прежде всего сделать для того, чтобы она была чистой ?

Перекреститься! :) Поскольку Вы не расшифровали термин "чистая", остается только догадываться. Самое главное - запросите в налоговой справку об отсутствии задолженности. Одновременно проверьте баланс и отчет на предмет задолженностей. Наличие судебных споров. Короче говоря, здесь невозможно прописать все мероприятия, проведя которые вы убедитесь, что ООО "чистая". Нужна "чистая" - открывайте новую и будете спокойны!