Какой вариант лучше покупать: выделенная комната или доля в процентном соотношении ? в чём суть разницы ?

Конечно, собственность в виде комнаты лучше. Потому что если доля, то все остальные сособственники долей имеют право пользоваться вашей долей (как и вы - их долями). Поэтому часто люди не могут договориться и приходится в суде определять порядок пользования долями, но не всегда метраж долей позволяет выделить целую комнату или, наоборот, комната будет меньше доли. Исключение составляют доли (знаю, в Питере такое), когда изначально приватизация коммуналок проводилась на доли - там размеры долей соответствуют размерам комнат.